Reconocido en América Latina. Localizada en la carrera 11 entre calles 19 y 20 conserva una de las capillas más importantes de América como La Capilla del Rosario, denominada la Capilla Sixtina de América; distinguen sus columnas y detalles en fondos rojos adornados con laminillas de oro.

La Capilla de Nuestra Señora del Rosario, sobre el costado sur de la nave central. adornada con grandes tableros de madera dorada que recubren los muros y representan los quince Misterios del Rosario, así: Al frente de los Gozosos; a la derecha, los Dolorosos; y los Gloriosos a la izquierda.

De todos los relieves, el más hermoso es el de la Anunciación, por la belleza del Ángel. La estatua de la Virgen parece ser pieza de filiación hispalense del Bajorrenacimiento.


Entre sus esculturas son dignas de destacar: La Virgen del Rosario, Santa Catalina, el grupo escultórico del Nazareno, el Judío y el Cirineo, tallados en madera en Tunja.

En las obras pictóricas, destacamos la Virgen de la Antigua de Angelino Medoro; Santa Catalina de Alejandría del pintor Vásquez de Arce y Ceballos y otros.

Esta Capilla única en el arte neogranadino. Además de su interés como conjunto especial, hay en ella ricas decoraciones de incuestionable influencia mestiza. 

En los finales del siglo XX el antiguo convento de Santo Domingo ha sido sede de diversas actividades de educación universitaria, inicialmente la Universidad de Boyacá y actualmente la Universidad de Santo Tomás.